MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Amycolicicoccus subflavus DQS3-9A1 chromosome

Total Repeats: 7715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015564	TCC	2	6	2232580	2232585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_015564	TG	3	6	2236002	2236007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_015564	GGA	2	6	2240352	2240357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_015564	AGT	2	6	2241456	2241461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_015564	GGTG	2	8	2241473	2241480	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_015564	CCAC	2	8	2241501	2241508	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3507	NC_015564	CCT	2	6	2243159	2243164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_015564	ACA	2	6	2243220	2243225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_015564	TGT	2	6	2243285	2243290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_015564	AAG	2	6	2243301	2243306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_015564	AGG	2	6	2243322	2243327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_015564	CGG	2	6	2245032	2245037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_015564	GAA	2	6	2245768	2245773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_015564	AG	3	6	2246242	2246247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_015564	TGG	2	6	2246304	2246309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_015564	TAGTG	2	10	2249308	2249317	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_015564	ATT	2	6	2249329	2249334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_015564	CTC	2	6	2249352	2249357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3519	NC_015564	TC	3	6	2252909	2252914	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_015564	GCT	2	6	2253746	2253751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_015564	AGC	2	6	2253785	2253790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_015564	TAG	2	6	2253835	2253840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_015564	CACC	2	8	2256377	2256384	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3524	NC_015564	AGT	2	6	2256910	2256915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_015564	TTGA	2	8	2256921	2256928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_015564	CT	3	6	2256943	2256948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_015564	TCC	2	6	2256962	2256967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_015564	GCT	2	6	2256999	2257004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_015564	CG	3	6	2257007	2257012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_015564	GCG	2	6	2258125	2258130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_015564	GCA	2	6	2258133	2258138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_015564	GCG	3	9	2260030	2260038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_015564	GTG	2	6	2260079	2260084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_015564	AGC	2	6	2260917	2260922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_015564	CGA	3	9	2260930	2260938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_015564	GCC	2	6	2260954	2260959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_015564	ATC	2	6	2261048	2261053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_015564	GGCG	2	8	2261108	2261115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3539	NC_015564	CGG	2	6	2261148	2261153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_015564	CGGT	2	8	2261562	2261569	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3541	NC_015564	AGA	2	6	2261621	2261626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_015564	TC	3	6	2261638	2261643	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_015564	GAC	2	6	2262590	2262595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3544	NC_015564	TAG	2	6	2262614	2262619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_015564	CACAA	2	10	2262648	2262657	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3546	NC_015564	GGC	2	6	2262674	2262679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015564	ATG	2	6	2262736	2262741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3549	NC_015564	G	6	6	2262869	2262874	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_015564	GCG	2	6	2264417	2264422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_015564	CGG	2	6	2264598	2264603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3553	NC_015564	GCG	2	6	2265157	2265162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_015564	GGT	2	6	2265281	2265286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_015564	GAG	2	6	2265324	2265329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3557	NC_015564	GCG	2	6	2265475	2265480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_015564	GCG	2	6	2265525	2265530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_015564	CCA	2	6	2265744	2265749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3560	NC_015564	GCA	2	6	2265750	2265755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_015564	CCG	2	6	2265798	2265803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_015564	CTG	2	6	2265826	2265831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_015564	TGG	2	6	2266461	2266466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_015564	CAA	2	6	2266501	2266506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_015564	TGCC	2	8	2266554	2266561	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_015564	CGA	3	9	2267003	2267011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3568	NC_015564	GTG	2	6	2267060	2267065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_015564	ACT	2	6	2267138	2267143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3574	NC_015564	CGGCG	2	10	2269014	2269023	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3575	NC_015564	GGGGT	2	10	2269937	2269946	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_015564	GTG	2	6	2269956	2269961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_015564	CAG	2	6	2269967	2269972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3579	NC_015564	CG	3	6	2272943	2272948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_015564	CGGA	2	8	2272974	2272981	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3581	NC_015564	CAA	2	6	2273024	2273029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3584	NC_015564	ACC	2	6	2273141	2273146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_015564	CCG	2	6	2273302	2273307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3588	NC_015564	ACG	2	6	2273372	2273377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_015564	ACT	2	6	2274439	2274444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3593	NC_015564	CTG	2	6	2276512	2276517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3596	NC_015564	CGG	2	6	2276667	2276672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_015564	ACC	2	6	2276678	2276683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3598	NC_015564	CGTG	2	8	2276762	2276769	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3599	NC_015564	G	6	6	2276778	2276783	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_015564	ACC	2	6	2278421	2278426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_015564	CTG	2	6	2278449	2278454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3603	NC_015564	CA	3	6	2279122	2279127	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3609	NC_015564	GCGG	2	8	2279778	2279785	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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3611	NC_015564	AAT	2	6	2280721	2280726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3615	NC_015564	CG	3	6	2284122	2284127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3620	NC_015564	GGCA	2	8	2285290	2285297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3621	NC_015564	AAG	2	6	2285334	2285339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_015564	AAG	2	6	2285356	2285361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_015564	AAC	2	6	2285402	2285407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_015564	CTT	2	6	2288409	2288414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_015564	GTG	2	6	2288522	2288527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3626	NC_015564	AGC	2	6	2288552	2288557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3627	NC_015564	GC	3	6	2288836	2288841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3628	NC_015564	TCGG	2	8	2288851	2288858	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_015564	TCG	2	6	2288975	2288980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3630	NC_015564	GCC	2	6	2289067	2289072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3631	NC_015564	GCC	2	6	2289120	2289125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3632	NC_015564	TCG	2	6	2289253	2289258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3633	NC_015564	GC	3	6	2289260	2289265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3634	NC_015564	GCC	2	6	2289279	2289284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3635	NC_015564	CTA	2	6	2289320	2289325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3638	NC_015564	CG	3	6	2289740	2289745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3639	NC_015564	CTA	2	6	2289780	2289785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3640	NC_015564	TCG	2	6	2289803	2289808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3652	NC_015564	CGGTC	3	15	2290061	2290075	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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3655	NC_015564	CGT	2	6	2290179	2290184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3661	NC_015564	GCCC	2	8	2292360	2292367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3662	NC_015564	CTG	2	6	2292384	2292389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3671	NC_015564	AGAA	2	8	2300890	2300897	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3760	NC_015564	TTC	2	6	2327504	2327509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3761	NC_015564	GCG	2	6	2327527	2327532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3762	NC_015564	GCT	2	6	2327584	2327589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3763	NC_015564	TGGT	2	8	2327594	2327601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3764	NC_015564	AAG	2	6	2327660	2327665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3769	NC_015564	GT	4	8	2328372	2328379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3770	NC_015564	GGC	2	6	2328448	2328453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3772	NC_015564	TCG	2	6	2328797	2328802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3773	NC_015564	GGAT	2	8	2328803	2328810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3774	NC_015564	CGATG	2	10	2328839	2328848	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3775	NC_015564	CTTC	2	8	2329420	2329427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3778	NC_015564	GTG	2	6	2331649	2331654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3784	NC_015564	GTC	2	6	2331881	2331886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3881	NC_015564	CCTGGA	2	12	2378187	2378198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3882	NC_015564	GTC	2	6	2378213	2378218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3883	NC_015564	GGA	2	6	2378230	2378235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3884	NC_015564	CG	3	6	2378260	2378265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3885	NC_015564	AGC	2	6	2378297	2378302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3886	NC_015564	GGC	2	6	2378369	2378374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3887	NC_015564	CCG	2	6	2378405	2378410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3888	NC_015564	AGG	2	6	2378411	2378416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3890	NC_015564	ACGG	2	8	2378426	2378433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3891	NC_015564	ACC	2	6	2378513	2378518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3894	NC_015564	GTC	2	6	2380310	2380315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3899	NC_015564	GAT	2	6	2380961	2380966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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